Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka1P18653 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka1P18653 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps6ka1P18653 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms