Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnaP17918 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnaP17918 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnaP17918 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcnaP17918 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnaP17918 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PcnaP17918 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnaP17918 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnaP17918 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnaP17918 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PcnaP17918 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnaP17918 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnaP17918 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms