Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs2P17534 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs2P17534 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs2P17534 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs2P17534 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Defa-rs2P17534 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa-rs2P17534 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms