Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scd1P13516 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scd1P13516 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scd1P13516 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scd1P13516 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scd1P13516 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scd1P13516 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scd1P13516 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scd1P13516 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scd1P13516 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scd1P13516 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scd1P13516 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scd1P13516 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scd1P13516 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scd1P13516 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scd1P13516 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms