Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa1P11477 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa1P11477 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa1P11477 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa1P11477 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa1P11477 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa1P11477 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa1P11477 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa1P11477 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa1P11477 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa1P11477 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa1P11477 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa1P11477 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms