Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sub1P11031 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sub1P11031 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms