Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nid1P10493 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nid1P10493 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nid1P10493 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nid1P10493 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nid1P10493 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nid1P10493 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms