Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06329 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06329 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06329 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06329 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06329 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06329 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06329 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06329 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06329 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06329 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06329 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06329 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06329 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06329 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06329 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06329 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06329 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06329 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms