Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01783 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01783 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01783 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01783 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01783 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01783 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01783 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01783 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01783 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01783 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01783 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01783 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01783 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01783 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01783 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01783 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01783 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01783 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01783 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01783 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01783 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01783 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01783 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01783 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01783 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01783 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01783 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01783 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01783 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01783 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01783 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01783 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01783 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01783 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms