Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx8O88983 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx8O88983 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx8O88983 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx8O88983 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx8O88983 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx8O88983 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms