Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt1O88346 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt1O88346 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt1O88346 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms