Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp9aO70228 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp9aO70228 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp9aO70228 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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