Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChkbO55229 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChkbO55229 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkbO55229 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms