Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr6O54689 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms