Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf12O35738 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf12O35738 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf12O35738 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf12O35738 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms