Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx1aO35526 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx1aO35526 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms