Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn6O35454 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn6O35454 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms