Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifc3O35231 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifc3O35231 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifc3O35231 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms