Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgisO35074 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgisO35074 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgisO35074 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgisO35074 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgisO35074 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtgisO35074 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgisO35074 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgisO35074 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms