Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn2O08529 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn2O08529 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn2O08529 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn2O08529 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn2O08529 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn2O08529 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn2O08529 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms