Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms