Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Arl9F7BE40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arl9F7BE40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl9F7BE40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms