Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5218F6YH22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms