Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21970F6XX07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21970F6XX07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms