Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gcom1E9PZ54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms