Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brd1E9PZ26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Brd1E9PZ26 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Brd1E9PZ26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brd1E9PZ26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms