Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6ap1lD3Z5W0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms