Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc6D3YZP9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc6D3YZP9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc6D3YZP9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc6D3YZP9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms