Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm11569B1AQB1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm11569B1AQB1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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