Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fibcd1A2AV25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fibcd1A2AV25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fibcd1A2AV25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms