Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb1A2AQ07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb1A2AQ07 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms