Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Shisal2aA2A9G7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2aA2A9G7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms