Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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