Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSPNQ9HAW4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms