Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cabp4Q8VHC5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cabp4Q8VHC5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms