Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms