Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
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