Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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APOFQ13790 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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APOFQ13790 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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APOFQ13790 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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APOFQ13790 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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APOFQ13790 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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