Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTP4A2Q12974 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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