Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms