Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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