Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms