Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ComtO88587 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ComtO88587 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ComtO88587 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ComtO88587 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ComtO88587 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ComtO88587 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ComtO88587 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ComtO88587 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ComtO88587 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms