Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms