Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms