Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms