Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mid2Q9QUS6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms