Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms