Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms