Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms